为便于供应商及时了解采购信息，现将江苏省疾病预防控制中心2025年度采购需求予以公告，有意向者须提供公司资质、报价单（需加盖公章、注明联系人、联系方式、单价、总价、参数响应承诺等）等资料发送至：jscdczw@jscdc.cn，邮件主题以“公司名称+项目名称+公告批次”命名，报名截止时间:  2025年12月11日 15点 30 分，以邮件发送时间为准。联系人：秦老师，联系电话：025-83759340。

　　测序服务要求如下：

　　1. 投标者需提供近三年内虫媒测序服务的完整案例，包括样品处理、分析流程和结果展示。

　　2. 样本的清洗和病毒的靶向捕获富集：使用蚊虫病毒靶向捕获试剂盒对样本DNA/RNA病毒进行捕获富集，宿主基因组和细菌性病原（如噬菌体）的去除率达95%以上。

　　3. 虫媒病毒特征数据库的建立：利用公开病毒数据库信息，如VOGDB数据库、VectorBase数据库和NCBI数据库等，筛选并建立虫媒病毒特征数据库，并用作后续的病毒物种注释。

　　4. 测序的数据量：要求每个样本测序有效数据量至少为10G。

　　5. 下机原始数据清洗和质控：用专业的质量控制工具（如FastQC和Trimmomatic）对原始测序数据进行质控，去除低质量的reads、适配器序列以及含有不明确碱基（N）的序列。同时，提供详细的质量评估报告，包括碱基质量分布、GC含量分布、序列重复性等指标。

　　6. 病毒的组装与鉴定

　　6.1 从头组装：序列组装要求使用高质量的从头组装工具（如megahit）进行基因组组装，生成连续且完整的contig/scaffold序列。通过序列聚类去冗余。

　　6.2 病毒序列识别：VirSorter2、DeepVirFinder和Virbrant病毒序列识别，三种方法取并集；

　　6.3 病毒序列评估 Check V: 利用上述三种方法取并集得到的病毒contigs文件进行序列检查，checkv输出的病毒contigs文件用于后续分析；

　　6.4 病毒序列丰度计算: clean reads与病毒contigs进行比对，计算RPKM；

　　6.5 病毒物种注释: 利用上述构建的虫媒病毒特征数据库进行病毒物种初步注释，数据库中无对应信息的序列通过公开数据库进行比对和物种预测。

　　6.6 宿主预测，CRISPR匹配，搜索细菌序列中的出crispr spacers，将其与病毒contigs进行比对；tRNA匹配 预测病毒contigs中的tRNA基因，用tRNA序列和细菌scaffold进行比对

　　6.7 vOTUs基因功能注释：将预测基因的蛋白序列分别与NR、Swiss-Prot、eggNOG、KEGG、GO、CAZy、SARG、BRG、MRG、VFDB等数据库进行比对，从而获得预测基因的注释信息。

　　7. 上述所有操作需进行统计分析与图形展示。

　　8. 项目初步结果反馈周期为14天内，后续针对需求可对该项目样本进行补测和无限次免费售后服务，包括数据个性化重处理和论文发表所需图片修改，售后期间积极回应项目需求等。