江苏省疾病预防控制中心(江苏省预防医学科学院)
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2025-12-04

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2025年度采购需求公告(第420批)-结核分枝杆菌全基因组测序

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  为便于供应商及时了解采购信息,现将江苏省疾病预防控制中心2025年度采购需求(第420批)予以公告,有意向者需提供:产品生产许可或者注册文件、企业经营许可、经营企业统一社会信用代码、销售代理授权、业务员授权等资料以及报价单(需加盖公章、注明联系人、联系方式)发送至:jscdczw@jscdc.cn,邮件主题以“公司名称+项目名称+公告批次”命名,报名截止时间:  2025年12月11日 17:30,以邮件发送时间为准。

  结核分枝杆菌全基因组测序服务技术参数(2025)

  1、    具备构建结核分枝杆菌基因组PE文库的经验,并提供相应证明材料。

  2、    核酸提取:对于灭活后细菌样本可提供基因组提取服务,同时对基因组进行质检,并提供样本基因组质检报告,若样本测序不成功,则不能收取该样本的所有费用。

  3、    测序数据分析:对测序的原始数据通过FastQC进行质量评估,每个样本提供1G以上clean data,,Q30大于80% ,Q20大于90%,基因组覆盖度大于95%;

  4、    数据基因组组装和质量评估:全基因组覆盖度达到95%以上,基因组平均覆盖深度100X及以上。具备深度测序(深度≥1000X)的能力。

  5、    基于全基因组数据鉴定分枝杆菌菌株类型,分析统计各菌株的SNP,分析菌株谱系,根据现有的结核菌耐药突变数据库鉴定各菌株相关的耐药突变(包括4个一线药物、10个二线药物),完成所有样本的成簇分析,计算菌株间的遗传距离和系统发育树。

  6、    收到样本后在三周内完成测序,按客户要求测序并提交客户要求格式报告。

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