为便于供应商及时了解采购信息，现将江苏省疾病预防控制中心2025年度采购需求予以公告，有意向者须提供公司资质、报价单（需加盖公章、注明联系人、联系方式、单价、总价、所有要求响应承诺等）等资料发送至：jscdczw@jscdc.cn，邮件主题以“公司名称+项目名称+公告批次”命名，报名截止时间:  2025年8月27日 15点 30 分，以邮件发送时间为准。联系人：秦老师，联系电话：025-83759340。

　　具体项目及要求如下：

　　宏基因测序数据（raw data）分析

　　样品种类：医院城市污水

　　样品份数：33份

　　数据种类：宏基因下机测序raw data

　　具体要求：

　　一、原始数据质控与预处理

　　1. 原始数据质量评估与清洗

　　如：使用 FastQC 评估原始数据质量；使用 fastp 或 Trimmomatic 进行清洗（去接头、低质量序列）。

　　2. 去除宿主污染（人类/动物DNA）

　　如：使用 Bowtie2 将reads比对至人类基因组（GRCh38），去除比对上的序列。

　　二、物种注释与多样性分析

　　1. 如：使用 Kraken2 + Bracken 进行微生物分类注释；

　　2. 多样性计算与可视化，包括α多样性，β多样性，差异分析：LEfSe、STAMP、DESeq2 等。

　　三、功能注释与拼接分析

　　1. 宏基因组拼接与基因预测；

　　2. 预测开放阅读框（ORFs）；

　　3. 功能注释（KEGG / eggNOG）；

　　四、抗生素抗性基因（ARGs）分析

　　1. ARGs注释/丰度计算；

　　2. ARG分布与可视化

　　五、消毒剂抗性基因（BRGs）分析

　　1. 比对 BacMet数据库；

　　2. BRGs丰度计算与分类

　　六、共现关系与可移动遗传元件分析

　　1. 质粒与整合子识别；

　　2. ARG/BRG 与宿主菌关系；

　　3. 共现网络分析：构建ARGs/BRGs-宿主共现网络/可视化。

　　七、统计分析与图形展示

　　表格格式规范（三线表格式，顶线，底线1.5磅栏目线0.75磅）

　　八、 针对该项目无限次售后免费服务，包括图片修改，售后期间积极回应项目需求等并提供详细的、分步骤的分析流程文档。